Druhou najpopulárnejšou a najčastejšie používanou štartovacou kultúrou po mezofilnom type sú teplomilné baktérie. Majú množstvo funkcií použitia a výrobných postupov.
Na rozdiel od bežných mezofilných fermentov, ktoré sa pridávajú do mlieka zohriateho na 25 - 30 stupňov Celzia, termofilné „tolerujú“30 - 40 stupňov a viac. Vďaka menšej náchylnosti na teplotné podmienky je tento druh syrovej prísady nepostrádateľný pri výrobe takzvaných extraktových syrov, ktoré sú veľmi populárne v Taliansku, ako aj pri opätovnom ohrievaní odrôd. Patria sem odrody „Mozzarella“, „Provolone“, „Romano“a rôzne odrody tradične vyrábané vo Švajčiarsku.
Hlavnými kmeňmi baktérií používaných pri príprave termofilných štartérov sú Streptococcus thermophilus, Lactobacillus delbrueckii ssp.bulbaricus a Lactobacillus helveticus. Prežívajú a dobre s mliekom interagujú pri teplotách do 65 stupňov Celzia. Pri nižšej teplote nie je vylúčené miešanie teplomilných štartovacích kultúr s mezafilnými.
Ak chcete pripraviť jednoduchý domáci syr alebo jeho polotvrdú verziu ako „Gouda“, potom jednoducho nepotrebujete teplomilné štartovacie kultúry. To isté platí pre odrody s rôznymi druhmi plesní - bielou, modrou, zelenou alebo červeno-oranžovou. V takom prípade si budete musieť kúpiť iba pravidelnú mezofilnú štartovaciu kultúru.
